色譜填充柱的填充劑是其中重要的部分，它通常是一種多孔吸附劑。填充劑的選擇根據所需的分析目標和樣品特性來進行。常用的填充劑包括吸附劑和分子篩。吸附劑是由高速液相色譜技術中吸附柱衍生而來，它可以根據樣品的化學性質進行選擇，例如常見的C18、C8和SiO2等。分子篩則是根據分子大小和形狀來選擇，如常用的葡萄糖胺、凱龍等。
填充柱中的填充劑具有大量的微小孔隙，這些孔隙可以吸附樣品中的化合物。當樣品進入填充柱后，填充劑表面的吸附作用會使得樣品分子附著在填充劑表面，從而被層析分離。不同的化合物具有不同的親合性和吸附能力，因此它們會以不同的速度通過填充柱進行分離。對于非極性化合物而言，它們往往被填充劑較強烈地吸附，因此會持留更長時間。而對于極性化合物而言，它們則往往很容易被填充劑釋放，因此會持留時間較短。
填充柱的柱壁是填充劑的載體，它可以有效固定填充劑并提供合適的通道用于樣品流動。柱壁的材料通常是不會與樣品發生反應的無機、有機材料，如玻璃、不銹鋼和聚酰胺等。柱壁的表面會被經過表面處理，增加填充劑的附著能力，從而提高分離效率。
填充柱還通常包含一層保護層，用于保護填充劑的穩定性和延長柱的使用壽命。保護層可以是化學惰性物質或具有特定的選擇性物質?；瘜W惰性物質例如聚硅氧烷，它可以減少填充劑與樣品之間的非特異性吸附。而具有選擇性物質的保護層，例如卡賓或酸類聚合物，可以通過特殊的相互作用來選擇性地吸附和分離樣品中的特定化合物。
色譜填充柱的應用主要包括以下幾方面：
1.可用于對復雜混合物進行分離，如蛋白質、核酸等，以獲取所需的目標化合物。
2.通過對填充柱中樣品組分的峰面積或峰高進行定量分析，可以確定樣品中目標物質的含量。
3.用于質量控制，確保產品的一致性和穩定性，如藥品質量控制、食品安全等。
4.通過對填充柱中樣品組分的保留時間和峰形進行分析，可以確定目標物質的結構和性質。
5.可以用于對復雜樣品的成分進行分析，如環境樣品中有機物的分析。
